全国人大常委会在下午的闭幕会议上，以全票一百五十八票，通过关于批准广深港高铁西九龙站设立口岸实施“一地两检”的决定草案，确认香港与广东两地政府签署的《合作安排》，符合宪法及基本法。人大常委会并公开《合作安排》，安排中写明内地边防检查机关、海关、检验检疫机构、口岸综合管理机关及铁路公安机关，会在内地口岸区执法。

《合作安排》指，香港与内地同意建立应急处理机制，在内地口岸区发生突发、紧急事件时，经内地派驻机构请求并授权，香港的人员可以在内地口岸区协助，会享有香港及内地法律的保障及豁免。