审计报告发现北大屿山医院第一期的设施、服务未有如期启用，医院大楼及医疗设备也未有充分利用。另外明爱医院第二期重建工程，核准工程预算大幅增加超过四成。

立法会公民党议员郭家麒回应报告时指，北大屿山医院落成至今四年，却只得四十张病床，妇科及儿科门诊仍未投入服务，表示很多东涌的病人需要转到玛嘉烈医院求诊，他又预计流感高峰期，将有八成人要转到玛嘉烈医院，预计医院人手负担更重，希望医管局正视。对于明爱医院第二期重建工程超支四成，郭家麒要求政府重新审视预算，适时增加拨款。