广深港高铁香港段由香港至福田的票价定为八十元，往广州南票价二百六十元。立法会铁路小组委员会主席田北辰认为，高铁往深圳福田与现在的落马洲支线相比，车程更舒适，票价增幅只是约一倍，相信可以吸引商务客，及方便未来往深圳创业的港人即日往返。立法会铁路事宜小组委员会副主席、民建联议员陈恒镔认为票价吸引力不足，相信不少市民，特别是新界区居民会选择到深圳乘坐高铁往广州。他认为高铁香港段应加密班次、和在开通初段提供票价优惠，才能提升吸引力和竞争力。

公民党议员陈淑庄质疑票价的吸引力，指政府在追加高铁拨款时，未有交代载客量估算和经济效益等数字，要求尽快交代。