广深港高铁票价定出，香港往来福田、深圳北、虎门及广州南站的票价，分别为八十、九十、二百一十及二百六十元，高峰期每日会有一百一十四对列车，当中三十对是来往香港至虎门及广州南 ，八十四对是来往香港至福田及深圳北。运输及房屋局局长陈帆为，相对于现在香港至广州直通车需二百一十元，高铁票价具吸引力。

有需要往返广东的市民欢迎安排，但也有人认为票价太贵。立法会铁路小组委员会主席田北辰认为，票价可以吸引商务客，高铁也方便未来往深圳创业的港人即日往返。立法会铁路事宜小组委员会副主席、民建联的陈恒镔则认为，票价吸引力不足，相信不少市民，特别是新界区居民会选择到深圳乘坐高铁往广州。公民党议员陈淑庄也质疑票价的吸引力，要求政府尽快交代载客量估算和经济效益等数据。