近期,科学家们在对新冠病毒和2003年暴发的SARS病毒进行了进化动态方面的比较和推演。他们惊讶地发现,疫情暴发至今仅5个月的时间内,新冠病毒(SARS-CoV-2)已在人体产生了调整适应,从而更顺畅地引发了大流行。
观察结果表明,2019年末首次检测到新冠病毒时,它已经预先适应了人类传播,其程度类似于SARS病毒流行的晚期阶段。但是,尚未发现源自人类适应性较差的新冠病毒进化前身或平行分支。

由于新冠病毒传染性极强、暴发模式不确定,引起了公众及国际社会的广泛关注,研究人员们期望查明来源,并防止在不久的将来这种流行病“卷土重来”。
加拿大英属哥伦比亚大学动物学系“生物多样性研究中心”的研究人员近日在bioRxiv上发表了相关研究,题为“SARS-CoV-2 is well adapted for humans. What does this mean for re-emergence? ”

为了寻找有关中间宿主的线索,研究人员们分析了有关新冠病毒如何动态进化和适应人类传播的最新关键发现,并研究了武汉华南海鲜市场的环境样本。
此前已有几份报告指出,新冠病毒在遗传上似乎比较稳定,适应压力不大,这对于诊断、疫苗和治疗方法的发展是一个好兆头。而特定的抗病毒剂、抗体或疫苗,对新冠病毒的有效时长,取决于目标基因或蛋白质的进化速度和扩展程度。
为了确定有效的治疗方法,研究团队提取了新冠刺突蛋白的精确结构,理想情况下是与潜在的候选药物结合——其中一些药物已经在进行临床试验。
那些与这类方法相冲突的新冠病毒变体——无论是传播力更强或已经不再适应宿主,对研究工作的进展都显然会产生非常不利的影响。因此,确定靶向的新冠病毒基因已经趋于稳定,并尽快鉴定出新的有毒变异体显得非常关键。
在本次分析中,研究人员们为以下人群选择了跨越3个月时间的高质量基因组:11种处于流行早期至中期的SARS病毒基因组,32种流行后期的SARS基因组,46种新冠病毒基因组(包括2019年12月上旬的分离株WuhanHu-1),以及今年1-3月每个月从不同地理区域采样的15个随机选择的基因组。
