特区政府公布广深港高铁香港段一地两检安排，将在西九龙总站设立內地口岸区，法律上视为香港特区区域范围以外，基本法第八、十八和二十二条的规范不适用，因此一地两检相关安排不违反基本法。

在对旅客的出入境监管方面，北上乘客在B1层购票后，将直接往B3层的香港口岸区办理出境手续，在离开香港口岸区后，法律上已离境，所以由B3层內地人员办理检验区域起，至离港乘客候车区、B4层月台及列车车厢，都属于內地口岸区。而由內地南下香港时，乘客经B4层月台到达B2层，须先办理內地出境程序，离开內地口岸区及进入香港口岸区后，才正式进入香港特区管辖范围。