一个容易引起争议的事情是，2012年11月，孙飘扬宣布，恒瑞医药旗下西帕替尼和海那替尼两款新药由于客观原因中止开发。而国家药品审评中心网站信息显示，该两项药品分别于2010年11月和2010年6月获临床批件，申报企业均为豪森药业。

孙飘扬还曾在公司年会上，将两家公司的销售额相加作为公司年度销售业绩。两家公司也多次出现药品批文、产品研发、销售渠道“不分彼此”的情况。另外2008年，孙飘扬公开表示“豪森迟早要收购过来，双方主要是在价格上还有分歧，另外豪森那边还有知识产权纠纷”。

市场长期的质疑，最终引起了监管层的重视。

2015年，上交所向恒瑞医药发出问询函，要求其针对媒体报道所涉及的“业务线高度重合”、“在药品批文、产品研发、销售渠道等方面不分彼此”以及“孙飘扬曾公开表示豪森会被并购至恒瑞医药旗下”等事项进行回应和披露。

对此，恒瑞医药在回复函中矢口否认，声称不存在“药界夫妻店”、“影子公司”、”持有股权”的情况，“公司和豪森医药独立研发、报批药品，具有不同药品批文。公司检索并对比国家食品药品监督管理总局药品审评中心网站的公示信息，双方报批药品无重叠，多数产品在适应症上和使用人群方面不一样，即使个别产品具有相同适应症，但都不是公司主要业务，不会彼此竞争，不存在不分彼此等情况”。

但事实上，由于孙飘扬和钟慧娟的夫妻关系，使其自动拥有夫妻共同财产的50%权益，彼时钟慧娟持有江苏豪森30.1%股份，孙飘扬不持有股权一说相当于空谈。此外，恒瑞医药与江苏豪森之间多年来一直保持采购商品、材料转让及加工费等关联交易。

这一切，都让豪森很难摆脱恒瑞“影子公司”的嫌疑，

不过或许也是这次问询事件以及外界持续不断的质疑，让豪森有了单独上市的计划。钟慧娟从2015年，开始着手清理股权。

2015年12月25日，经过一系列重组，江苏豪森成为翰森制药间接全资附属公司，钟慧娟和其女儿则为翰森制药的最大股东。

港股医药股新贵

2015年之后，作为豪森的掌门人，钟慧娟一边理清股权结构，一边加大药物研发力度。2016年、2017年和2018年，其研发支出一路走高，分别为4.03亿元、5.76亿元和8.81亿元。研发的大投入，也带来了其收入的快速增长。